早期的牙龈萎缩，会导致紧密包裹牙齿的天然屏障出现缝隙，成为牙石进入龈下的缺口，而龈下牙石是牙周病菌滋生的必要载体，因而可以说牙龈萎缩是导致牙周炎的直接原因；
牙龈出现萎缩后，不能再像从前一样紧密包裹牙根，结果导致牙周组织（内牙龈）也被暴露出来，口腔中的各种细菌（尤其是厌氧菌）及牙结石直接侵袭牙周组织引发牙周炎。牙周炎又会反过来加剧牙龈萎缩，加速牙槽骨被吸收，这种恶性循环，导致牙龈水平下降、牙缝增大、牙根外露、牙齿松动，其结果不仅是摧毁牙龈健康、毁灭牙齿，更严重的是，每一颗患牙的牙周组织就像一个工厂，每时每刻都在产生病菌病毒，并通过血液向全身输送，严重威胁身体健康。
长时间的牙龈萎缩还会导致牙根外露（牙本质部分），由于牙根的表面没有牙釉质，一旦没有了牙龈的保护，不仅容易在刷牙时受到磨损，同时对冷、热、酸的刺激非常敏感，口腔医学称为“牙本质过敏”，人们常把这种现象误认为是露出牙神经导致疼痛，这是不对的，也造成对这种牙根过敏的治疗方法不对症，效果自然也不会好。